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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210564228.8 (22)申请日 2022.05.23 (71)申请人 杭州快通科技有限公司 地址 310000 浙江省杭州市钱塘区下沙街 道围垦街850号4#办公大楼14层1401、 1409室 (72)发明人 赵俊 (74)专利代理 机构 上海申新 律师事务所 31272 专利代理师 郎祺 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/6844(2018.01) (54)发明名称 一种引物组合物及其核酸扩增检测方法与 应用 (57)摘要 本发明涉及一种引物组合物及其核酸扩增 检测方法与应用; 引物组合物包括: 第一茎环引 物、 第二茎环引物、 通用引物以及前导引物; 第一 茎环引物的核苷酸序列自5 ’端至3’端依次包括: 第一茎序列、 突环序列、 第二茎序列以及第一引 物; 靶序列的互补序列与且仅与第一引物特异性 结合; 第二茎环引物的核苷酸序列自5 ’端至3’端 依次包括: 第一茎序列、 突环序列、 第二茎序列以 及第二引物; 靶序列与且仅与第二引物特异性结 合; 通用引物的核苷酸序列包括: 突环序列; 前导 引物与靶序列的互补序列特异性结合, 且前导引 物与靶序列的互补序列特异性结合的位点位于 第一引物与靶序列的互补序列特异性结合位点 的5’端上游。 权利要求书2页 说明书7页 序列表2页 附图3页 CN 115094057 A 2022.09.23 CN 115094057 A 1.一种引物组合物, 用于核酸快速扩增与检测, 其特征在于, 包括: 第一茎环引物(1)、 第二茎环引物(2)、 通用引物(3)以及前导引物(4); 其中, 所述第一茎环引 物(1)的核苷酸序列自5 ’端至3’端依次包括: 第一茎序列(11)、 突环序列(12)、 第二茎序列(13)以及第一引物(14); 所述第一茎序列(11)、 所述突环序列 (12)以及所述第二茎序列(13)构成第一茎环结构, 靶序列的互补序列与且仅与所述第一引 物(14)特异性结合; 其中, 所述第二茎环引物(2)的核苷酸序列自5 ’端至3’端依次包括: 所述第一茎序列 (11)、 所述突环序列(12)、 所述第二茎序列(13)以及第二引物(21); 所述第一茎序列(11)、 所述突环序列(12)以及所述第二茎序列(13)构成所述第一茎环结构, 靶序列与且仅与所述 第二引物(21)特异性结合; 其中, 所述 通用引物(3)的核苷酸序列包括: 所述 突环序列(12); 其中, 所述前导引物(4)与所述靶序列的互补序列特异性结合, 且所述前导引物(4)与 所述靶序列的互补序列特异性结合的位点位于所述第一引物(14)与所述靶序列的互补序 列特异性结合 位点的5’端上游。 2.根据权利要求1所述的引物组合物, 其特征在于, 所述通用引物(3)为第一通用引物 (31)或/和第二通用引物(32); 所述第一通用引物(31)以及所述第二通用引物(32)的核苷 酸序列均包括: 所述 突环序列(12)。 3.根据权利要求2所述的引物 组合物, 其特征在于, 所述第一通用引物(31)的核苷酸序 列为所述 突环序列(12)。 4.根据权利要求2所述的引物 组合物, 其特征在于, 所述第二通用引物(32)的核苷酸序 列自5’端至3’端依次包括: 具有第二茎环结构的信标序列(321)以及所述 突环序列(12)。 5.一种采用如权利要求1 ‑4任一项所述引物 组合物的核酸扩增检测方法, 其特征在于, 步骤包括: S1、 所述第二茎环引物(2)与RNA靶序列特异性结合, 在逆转录酶的作用下合成cDNA; S2、 所述第一茎环引物(1)与所述cDNA特异性结合, 在DNA聚合酶的作用下合成DNA; 由于所述前导引物(4)与所述cDNA特异性结合的位点位于所述第一茎环引物(1)与所 述cDNA特异性结合位点的5 ’端上游, 故而所述第一茎环引物(1)引导合 成的DNA被所述前导 引物(4)替换并成为ssDNA, 该ssDNA的核苷 酸序列自5 ’端至3’端依次包括: 所述第一茎环引 物(1)、 所述RNA靶序列逆转录合成的DNA序列以及所述第二茎环引物(2)的互补序列; S3、 在DNA聚合酶的作用下, 前一步骤获得的ssDNA, 自最末端的所述第二茎环引物(2) 的互补序列的3 ’端延伸合成dsDNA; S4、 所述通用引 物(3)与前一步骤合成的dsDNA中所述第二茎环引 物(2)中所述突环序 列(12)的互补序列特异性结合, 在DNA聚合酶的作用下, 合成包括所述第一茎环引物(1)的 互补序列的DNA; 由于前一步骤合成的dsDNA中未作为本步骤中DNA合成模板的核苷酸序列与本步骤新 合成的DNA的核苷酸序列相同, 故而前一步骤合成的dsDNA中未作为本步骤中DNA合成模板 的核苷酸序列被本步骤新 合成的DNA替换并成为s sDNA; S5、 在DNA聚合酶的作用下, 前一步骤获得的ssDNA, 自最末端的所述第一茎环引物(1) 的互补序列的3 ’端延伸合成dsDNA;权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115094057 A 2S6、 所述通用引 物(3)与前一步骤合成的dsDNA中所述第一茎环引 物(1)中所述突环序 列(12)的互补序列特异性结合, 在DNA聚合酶的作用下, 合成包括所述第二茎环引物(2)的 互补序列的DNA; 同时, 前一 步骤合成的dsDNA成为s sDNA; S7、 循环步骤S3 至步骤S6若干次。 6.根据权利要求5所述的核酸扩增检测方法, 其特征在于, 所述核酸扩增检测方法采用 恒定温度扩增检测, 所述恒定温度扩增检测中的温度为 40℃‑70℃。 7.根据权利要求5所述的核酸扩增检测方法, 其特征在于, 所述DNA聚合酶为带链置换 的DNA聚合酶。 8.根据权利要求7所述的核酸扩增检测方法, 其特征在于, 所述DNA聚合酶选自Bst DNA 聚合酶、 Bsu DNA聚合酶、 Phi2 9 DNA聚合酶 或SD Taq DNA聚合酶中的至少一种。 9.一种如权利要求1 ‑5任一项所述引物组合物或如权利要求6 ‑8任一项所述核酸扩增 检测方法在制备病原体 检测试剂盒中的应用。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115094057 A 3
专利 一种引物组合物及其核酸扩增检测方法与应用
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