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ICS 11.220 B 41 DB33 浙 江 省 地 方 标 准 DB33/T 2268—2020 猫细小病毒 PCR 检测方法 PCR detection technique for feline panleukopenia virus 2020 - 06 - 30 发布 浙江省市场监督管理局 2020 - 07 - 30 实施 发 布 DB33/T 2268—2020 前 言 本标准按照GB/T 1.1—2009的规定编写。 本标准由浙江省农业农村厅提出。 本标准由浙江省畜牧兽医和饲料标准化技术委员会归口。 本标准起草单位:浙江省动物疫病预防控制中心。 本标准主要起草人:张红丽、徐 辉、赵灵燕、周彩琴、吴贇竑、黄 靖、吕见涛、刘爱军、刘 霞、 吴雪军、孙冰冰、章杭建。 I DB33/T 2268—2020 猫细小病毒 PCR 检测方法 1 范围 本标准规定了猫细小病毒PCR(polymerase chain reaction)的实验条件、操作步骤、结果判定。 本标准适用于猫细小病毒(猫泛白细胞减少症病毒)的检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 猫细小病毒 Feline panleukopenia virus,FPLV 属细小病毒科,细小病毒亚科,牛犬细小病毒属成员,又称猫泛白细胞减少症病毒、猫传染性胃肠 炎病毒或猫瘟病毒。 4 实验条件 4.1 试剂 4.1.1 要求 除另有规定外,所用试剂为分析纯或生化试剂,水为符合GB/T 6682要求的灭菌双蒸水或超纯水。 4.1.2 试剂 4.1.2.1 核糖核酸酶(20 mg/mL)。 4.1.2.2 10%十二烷基磺酸钠溶液。 4.1.2.3 10 mg/mL 蛋白酶 K。 4.1.2.4 Tris-盐酸饱和酚(pH 7.6)。 4.1.2.5 酚-氯仿-异戊醇混合液(25:24:1):在一灭菌棕色瓶中按 25:24:1 比例分别加入酚、氯 仿、异戊醇。 4.1.2.6 3 mol/L 乙酸钠(pH 5.4)。 4.1.2.7 琼脂糖。 1 DB33/T 2268—2020 4.1.2.8 10 μg/μL 溴化乙锭(ethidium bromide, EB):溴化乙锭 20 mg、加灭菌双蒸水至 20 mL 充 分溶解混匀而成。 4.1.2.9 50×TAE 缓冲液:羟基甲基氨基甲烷(Tris)242 g、冰乙酸 57.1 mL、0.5 mol/L 乙二铵四乙 酸二钠溶液(pH 8.0)100 mL,加灭菌双蒸水至 1 000 mL 充分混匀。 4.1.2.10 加样缓冲液:聚蔗糖 25 g、溴酚蓝 0.1 g、二甲苯青 0.1 g,加灭菌双蒸水至 100 mL 充分溶 解混匀而成。 4.1.2.11 2.5 mmol dNTPs(deoxyribonucleoside triphosphates,脱氧核糖核苷三磷酸)。 4.1.2.12 10×PCR Buffer。 4.1.2.13 DNA 分子量标准:DL2000。 4.1.2.14 引物序列 FPLV-F:5'—CCAGCTGAGGTTGGTTATAGTG—3';FPLV-R:5'—GGTGCATTTACATGAAGTCTT GG—3'。 4.2 仪器设备 4.2.1 4.2.2 4.2.3 4.2.4 4.2.5 4.2.6 4.2.7 4.2.8 4.2.9 4.2.10 4.2.11 高速冷冻离心机:要求最大离心力在 12 000rpm 以上。 PCR 扩增仪。 核酸电泳仪和水平电泳槽。 微波炉。 分析天平。 恒温水浴锅。 冷藏冰箱和低温冷冻冰箱。 微量移液器。 凝胶成像系统(或紫外透射仪)。 高压灭菌锅。 超净工作台或生物安全柜。 5 操作步骤 5.1 样品的采集和处理 5.1.1 a) b) c) 采集动物粪便、肛拭子、全血或肠道等组织样品并进行处理: 肛拭子、粪便(加适量 PBS)等样品经 4 ℃ 5 000 rpm/min 离心 2 min,取上清液; 全血样品待血凝后经 5 000 rpm/min 离心 2 min,取血清; 取 0.1 g 肠道等样品与灭菌 PBS(全称、浓度)按 1:5 的重量体积比制成悬液,匀浆后,反复 冻融 3 次,在涡旋混合器上混匀后经 4 ℃ 5 000 rpm/min 离心 10 min,取上清液。 5.1.2 制备的样品在 2 ℃~8 ℃保存时间不应超过 24 h,长期保存应分装成小管,置于-20 ℃以下,避 免反复冻融。 5.2 DNA 的提取 5.2.1 设立阳性、阴性样品对照,阳性对照为猫细小病毒阳性样品,阴性对照为灭菌双蒸水。 5.2.2 按下列步骤完成 DNA 的提取,也可选择市售商品化 DNA 提取试剂盒,完成 DNA 的提取: a) 取 1.5 mL 灭菌离心管,加入处理样品 5.1.1 上清液 400 µL 和 30 µL(20 mg/mL)核糖核酸酶, 混匀后,室温下作用 20 min; 2 DB33/T 2268—2020 b) 加入 43 µL 10%的十二烷基磺酸钠溶液和 5 µL 蛋白酶 K,42 ℃水浴温育过夜(或 55 ℃30 min 以上); c) 加入等量的 Tris-盐酸饱和酚,充分混匀,12 000 rpm/min 离心 5 min,小心吸出上层水相于 新的 1.5 mL 灭菌离心管中; d) 加等量的酚-氯仿-异戊醇(25:24:1),充分混匀,12 000 rpm/min 离心 5 min,小心吸出上 层水相至新的 1.5 mL 灭菌离心管中; e) 加 1/10 体积 3 mol/L 的乙酸钠(pH 5.4),2.5 倍体积预冷的无水乙醇 15 000 rpm/min 离心 20 min,弃去乙醇,75%的乙醇洗涤沉淀一次后真空干燥。用 20 µL 灭菌双蒸水溶解沉淀,-20 ℃ 保存备用。 5.3 PCR 反应 5.3.1 反应体系组成 设立阳性对照和阴性对照。按表 1 所述反应体系组成,严格在冰盒上配置 25 µL PCR 扩增体系。 表1 每个样品反应体系配制表 试剂 用量(µL) 10×PCR buffer 2.5 dNTPs(2.5 mM) 2 FPLV-F/FPLV-R(20 uM) 各 0.5 TaqDNA 聚合酶(Taq DNA Polymerase) 0.2 DNA 模板 1 灭菌双蒸/超纯水 18.3 总量 25 5.3.2 反应条件 94 ℃ 3 min;94 ℃ 45 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,循环 35 次,72 ℃延伸 10 min 结束。 5.4 电泳 5.4.1 1%琼脂糖凝胶的制备 用琼脂糖1.0 g,0.5×TAE 电泳缓冲液100 mL,混匀后在微波炉中完全融化,待冷至50 ℃~60 ℃时, 加溴化乙锭(EB)溶液5 μL,摇匀倒入电泳板上,凝固后取下梳子,备用。 5.4.2 加样 取5 μL PCR产物与0.5 μL 10×加样缓冲液混合,加入琼脂糖凝胶板的加样孔中。每次电泳加阳性 对照和阴性对照的扩增产物,并设立DNA分子量标准(DL2000)做分子质量大小对照。 5.4.3 电泳 3 DB33/T 2268—2020 盖好电泳仪,插好电极,5 V/cm 电压电泳,30 min~45 min(指示试剂跑至 1/3 处)。 5.4.4 结果观察 用紫外凝胶成像仪或者紫外透射仪观察扩增结果。 6 结果判定 在阳性对照出现 464 bp 的扩增带、阴性对照无目的条带的条件下,待检样品出现 464 bp 的扩增条 带,则判定为样品阳性,否则判定为阴性。 _________________________________ 4

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