ICS 11.220 B 41 DB37 山 东 省 地 方 标 准 DB 37/T 3673—2019 牡蛎疱疹病毒 І 型检测技术规范 法 巢式 PCR Ostreid herpesvirus-1 Detection Specification- Nested PCR 2019 - 08 - 30 发布 山东省市场监督管理局 2019 - 09 - 30 实施 发 布 DB37/T 3673—2019 目 前 次 言 ............................................................................ II 1 范围 ............................................................................... 1 2 规范性引用文件 ..................................................................... 1 3 术语和缩略语 ....................................................................... 1 3.1 术语和定义 ..................................................................... 1 3.2 缩略语 ......................................................................... 1 4 试剂及仪器 ......................................................................... 1 4.1 试剂 ........................................................................... 2 4.2 仪器 ........................................................................... 2 5 采样 ............................................................................... 3 5.1 采样对象 ....................................................................... 3 5.2 采样数量、方法和保存运输 ....................................................... 3 5.3 样品的采集 ..................................................................... 3 6 检测 ............................................................................... 3 6.1 DNA 的提取 ...................................................................... 3 6.2 巢式 PCR 操作步骤 ............................................................... 3 6.3 电泳及测序 ..................................................................... 4 7 结果 ............................................................................... 4 7.1 结果判定 ....................................................................... 4 7.2 结果表述 ....................................................................... 4 附 录 A (规范性附录) 试剂及配制方法 .............................................. 5 附 录 B (资料性附录) 检测目的片段的 DNA 序列及电泳图 .............................. 7 I DB37/T 3673—2019 前 言 本标准按照GB/T 1.1—2009给出的规则起草。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利,本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。 本标准由山东省农业农村厅提出并监督实施。 本标准由山东省渔业标准化技术委员会(鲁TC 03)归口。 本标准起草单位:山东农业大学、济宁滨阳生物科技股份有限公司、泰安益海生物科技有限公司、 泰安智博生物科技有限公司、南京根洋生物科技有限公司、南京少伯生物科技有限公司、南京福海生物 科技有限公司。 本标准起草人:王雪鹏、丁雷、闫现广、王方鹏、郭志明、孙永灿、付天增、姜衡、黄金菁。 II DB37/T 3673—2019 牡蛎疱疹病毒 І 型检测技术规范 巢式 PCR 法 1 范围 本标准规定了牡蛎疱疹病毒І型(Ostreid herpesvirus-1,OsHV-1)的巢式PCR检测方法,适用于 对贝类样品进行疱疹病毒І型带毒情况的定性检测,以进行牡蛎疱疹病毒І型的流行病学调查、诊断、检 疫和监测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 SC/T 7205.1 牡蛎包纳米虫病诊断规程 3 术语和缩略语 3.1 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1.1 牡蛎疱疹病毒І型 牡 蛎 疱 疹 病 毒І型 属 于 软 体 动 物 疱 疹 病 毒 科 ( Malacoherpesviridae ) 、 牡 蛎 疱 疹 病 毒 属 (Ostreavirus),是一种双链DNA病毒,在世界范围内广泛流行,主要危害牡蛎、扇贝和魁蚶等多种双 壳贝类,对贝类养殖业造成重大的损害。 3.2 缩略语 下列缩略语适用于本文件。 bp:碱基对(base pair) dNTPs:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphate) DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid) EB:溴化乙啶(ethidium bromide) EDTA:乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid) PCR:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction) Taq:水生栖热菌(thermus aquaticus) TE:Tris盐酸和EDTA缓冲液(EDTA Tris·HCl) Tris:三羟甲基氨基甲烷(tris hydroxymethyl aminomethane) 4 试剂及仪器 1 DB37/T 3673—2019 4.1 试剂 4.1.1 除非另有说明,实验用水均为 GB/T 6682 规定的三级水或相当纯度的水。 4.1.2 无水乙醇:分析纯。 4.1.3 TE 缓冲液按附录 A.1 的规定。 4.1.4 抽提缓冲液按附录 A.2 的规定。 4.1.5 蛋白酶 K 按附录 A.3 的规定。 4.1.6 10 mol/L 乙酸铵按附录 A.4 的规定。 4.1.7 Tirs 饱和酚(pH≥7.8):分析纯。 4.1.8 4.1.8 酚/氯仿/异戊醇(25:24:1):分析纯。 4.1.9 4.1.9 氯仿/异戊醇(24:1):分析纯。 4.1.10 50×TAE:见附录 A.5,也可以直接购买市售产品。 4.1.11 1×TAE:见附录 A.5。 4.1.12 70 %乙醇按附录 A.6 的规定。 4.1.13 dNTP(各 2.5 mmol/L):生化试剂,含 dATP、dTTP、dGTP、dCTP 各 2.5 mmol/L 的混合物, -20 ℃保存,用于 PCR。 4.1.14 10×PCR 反应缓冲液:见附录 A.7,也可以直接购买市售产品。 4.1.15 MgCl2 (25 mmol/L):生化试剂,-20 ℃保存。 4.1.16 Taq DNA 聚合酶(5 U/μL):生化试剂,-20 ℃保存。 4.1.17 外引物 CF:5’-ATTACCCAGATTCCCCTC-3’,-20 ℃保存。 4.1.18 外引物 CR:5’-CCACAAATGTAAACTGTGAC-3’,-20 ℃保存。 4.1.19 内引物 C3:5’-GTGTTCTATACCATACGACCTACA-3’,-20 ℃保存。 4.1.20 内引物 C2:5’-TTGCGTTCCGTGACTTCT-3’-20 ℃保存。 4.1.21 PCR 检测阳性对照:已知受牡蛎疱疹病毒 І 型感染的贝类组织样品,-80 ℃保存。 4.1.22 PCR 检测阴性对照:已知未受牡蛎疱疹病毒 І 型感染的贝类组织样品,-80 ℃保存。 4.1.23 PCR 检测空白对照以灭菌双蒸水作模板。 4.1.24 琼脂糖:分析纯。见附录 A.8。 4.1.25 6×Loading Buffer:附录 A.9,也可以直接购买市售产品。 4.1.26 DNA 分子量标准。 4.1.27 溴化乙锭(EB):分析纯,10 mg/mL,见 A.10,或其他等效产品。 4.2 仪器 4.2.1 4.2.2 4.2.3 4.2.4 4.2.5 4.2.6 4.2.7 4.2.8 4.2.9 4.2.10 4.2.11 离心机。 PCR 仪。 电泳仪。 水平电泳槽。 凝胶成像系统或紫外仪。 多功能振荡器。 水浴锅或金属浴。 -20 ℃普通冰箱。 –80 ℃超低温冰箱。 微波炉电炉或其他加热设备。 微量移液器:量程 0.5 μL~1 000 μL。 2 DB37/T 3673—2019 5 采样 5.1 采样对象 牡蛎、扇贝和魁蚶等易感双壳贝类。 5.2 采样数量、方法和保存运输 采样数量、方法和保存运输应符合SC
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